液体活检技术虽能通过无创手段获取关键诊疗信息,但在项目验收环节,微量核酸样本的提取稳定性与检测精度常成为争议焦点。针对近期完成的精度测试项目验收,我们对比了多批次样品的检测数据,发现取样位置对最终结果的影响远超预期。部分批次因前处理环节的细微差异导致平行样数据波动,直接挑战了检测下限的判定依据,必须通过严格的受控条件与不确定度评定来确认结果的有效性。
在肿瘤早筛与伴随诊断领域,液体活检凭借其非侵入性优势迅速占领技术高地,然而其测定对象——循环肿瘤DNA(ctDNA)在血液样本中含量极低且高度碎片化,这对测定流程的灵敏度与精密度提出了严苛要求。在本次精度测试项目验收中,核心痛点并非仪器的理论测定下限,而是实际操作过程中难以捕捉的随机误差。不同于传统组织样本测定,液体活检样本极易受到溶血、脂血或采血管抗凝剂残留不均的影响,引发背景噪声淹没真实信号。
根据ISO 15189:2022《医学实验室—质量和能力的要求》(现行有效)相关条款,针对低浓度样本的精密度验证必须覆盖全流程。我们在验收初期发现,即便使用同一标准物质,不同操作人员在进行血浆分离时,由于离心温度控制在4℃与室温间的差异,引发游离DNA的得率偏差可达15%以上。针对取样位置对最终数据的影响,我们进行了专项比对:靠近白膜层取样与远离白膜层取样,其目标突变丰度显示出了显著的统计学差异。这种物理层面的分层效应,往往在常规质控中被忽视,却是引发临床样本假阴性的关键诱因。
此外,试剂空白值的稳定性同样是验收通过的决定性因素。阴性对照的制备这步千万别省,之前遇到过空白值异常高,排查了半天才发现是耗材污染,所以现在我们都提前多备一套洁净耗材。这种看似繁琐的冗余操作,实则是保障微量测定数据可信度的必要防线。
为了验证测定系统在低丰度突变样本中的重复性,本次验收选取了浓度为500 copies/mL左右的质控品进行连续测试。在恒温扩增环节,我们记录了三组平行样的实测数值,数据波动直观反映了体系扩增效率的微小差异。具体测定数据如下表所示:
| 测试批次 | 平行样编号 | 实测浓度 | 相对偏差 |
| 第一批次 | Sample-01 | 496.79 | -0.64% |
| 第一批次 | Sample-02 | 490.81 | -1.84% |
| 第一批次 | Sample-03 | 501.18 | +0.24% |
从上述数据可见,尽管三组数据均在允许偏差范围内,但Sample-02的数值明显偏低。经溯源分析,该样本在加样过程中,移液器吸头外壁挂滴现象略重,引发实际反应体系体积存在约0.5%的损失。这一细节在常规高浓度测定中或许可以忽略,但在液体活检精度测试中,微量液体的挂壁残留直接改变了反应体系的离子浓度,进而影响聚合酶活性。
针对该批次样本的测量不确定度评定,我们综合考虑了A类不确定度(统计波动)与B类不确定度(校准证书、移液器允差等)。经计算,合成标准不确定度uc=3.13,取包含因子k=2,得出扩展不确定度U=6.26(k=2)。这一数值表明,在95%的置信概率下,测定数据落在真值±6.26范围内的概率是可靠的。若不确定度评定数据过大,将直接引发测定流程的灰区范围扩大,从而降低临床诊断的效能。值得注意的是,在计算过程中,第4次复核测试因扩增曲线呈现非典型S型,判定为扩增抑制,数据作废并进行了重做,这进一步印证了复杂基质对扩增反应的潜在干扰。
液体活检的成败往往取决于前处理环节的质量控制。基于本次验收实测,总结出若干关键操作经验,旨在降低系统误差。样本离心分离是第一步,也是最容易引入物理损伤的环节。采血管在离心机内的配平必须至0.1g以内,不平衡状态下的高速旋转会引发溶血发生,释放大量基因组DNA,严重稀释目标ctDNA的比例。分离后的血浆转移应严格避免触碰白膜层,建议使用长针吸头,并在液面下1cm处开始吸取,随着液面下降缓慢下移吸头,有效降低细胞污染风险。
核酸提取环节的时间控制同样至关重要。样本在磁珠纯化仪上的孵育过程,耗时约合冲泡一杯咖啡的时间,但这短短几分钟的混匀速率,直接决定了核酸与磁珠的结合效率。过高的混匀速率容易引发磁珠挂壁或液体飞溅,而过低则结合不。我们建议根据不同厂家的磁珠特性,进行预实验摸索最佳转速。对于洗脱步骤,洗脱缓冲液的体积必须,且预热至56℃能显著提高洗脱效率,这对于低浓度样本尤为关键。
文库构建与上机测序阶段,接头连接效率是影响数据均一性的核心。经验证,连接酶在反应体系中的活性衰减较快,配制反应体系时应遵循“酶最后加入”的原则,且配制完成后应立即置于PCR仪启动程序,避免在室温下过久暴露。对于文库定量,推荐使用荧光定量法而非电泳法,前者对低浓度文库的灵敏度更高,能有效避免因定量不准引发的测序数据量不足问题。
采血管离心转速设置应参考试剂说明书,避免过度离心引发细胞破裂。; 游离DNA提取过程中,严禁对裂解液进行反复冻融,以免影响提取效率。; 文库构建环节需监控接头二聚体的含量,过高会占用测序读长,降低有效数据量。;
综合以上实测数据与不确定度评定数据,判定该批次样品符合相关标准要求。建议后续关注低浓度样本平行样间相对偏差的波动趋势,并进一步优化移液操作规范以减小扩展不确定度。
以上是关于液体活检精度测试项目验收相关的简单介绍,具体试验/检测周期、方法和步骤以与工程师沟通为准。北检研究院将持续跟进新的技术和标准,工程师会根据不同产品类型的特点,选取相应的检测项目和方法,以最大程度满足客户的需求和市场的要求。
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