批量rna测序检测

检测项目

文库浓度测定：采用荧光定量法，检测范围0.1-2000nM，Qubit检测精度±5%

插入片段分布：毛细管电泳检测，尺寸范围100-1000bp，分辨率±5bp

序列质量评估：FastQC分析，Phred评分≥Q30占比＞85%

基因表达定量：FPKM/TPM标准化计算，检测灵敏度0.01TPM

差异表达分析：DESeq2算法，Fuld Change≥2且FDR<0.05

可变剪接检测：rMATS分析，显著性阈值PSI变化≥10%

融合基因鉴定：STAR-Fusion检测，支持读段≥5条

SNP/InDel变异：GATK流程，覆盖深度≥30X

新转录本预测：StringTie组装，最小长度200bp

功能富集分析：GO/KEGG注释，p值校正方法Benjamini-Hochberg

检测范围

哺乳动物组织样本：包括冻存组织/FFPE样本，RNA完整性RIN≥7

血液免疫细胞：外周血单核细胞分离，CD45+纯度≥95%

植物全转录组：适用于木质部/韧皮部等特殊组织

微生物群落：环境样本宏转录组分析，16S rRNA去除率>99%

细胞系培养物：悬浮/贴壁细胞，活细胞率≥90%

外泌体RNA：血清/血浆来源，small RNA富集检测

单细胞悬液：基于10x Genomics平台，细胞活性>80%

古生物样本：特殊降解RNA处理，片段化程度评估

病原体检测：宿主背景去除，病原RNA检出限1copies/μl

模式生物胚胎：斑马鱼/果蝇等发育阶段特异性分析

检测标准

ISO/IEC 17025:2017 检测实验室通用要求

ISO 20395:2018 高通量测序技术要求

GB/T 37872-2019 RNA测序质量要求

GB/T 34796-2017 核酸浓度测定方法

EN ISO 15189:2012 医学实验室质量要求

ASTM E3134-18 测序数据存储规范

CLSI MM19-A2 分子检测方法验证指南

GB/T 30988-2014 生物样本库质量规范

Illumina Sequencing Platform SOP v5.3

MINSEQE 转录组数据报告标准

检测仪器

Illumina NovaSeq 6000测序仪：通量20亿reads/run，双端测长150bp，用于全转录组数据采集

Agilent 4200 TapeStation系统：灵敏度0.5ng/μl，执行RNA完整性检测

Beckman Coulter Biomek i7自动化工作站：移液精度±0.5%，完成文库构建标准化

Thermo Fisher QuantStudio 5 qPCR仪：动态范围10¹-10¹⁰拷贝，用于文库定量校准

Covaris M220超声破碎仪：聚焦超声能量50W，控制片段化精度±10bp

Bio-Rad CFX96实时荧光定量系统：检测限100fg/μl，执行质控标准品验证

Eppendorf Centrifuge 5424R：转速15000rpm，用于RNA沉淀纯化

Nanodrop One超微量分光光度计：检测范围2-3700ng/μl，执行核酸浓度初筛

检测优势

1. 确保安全：通过检测可以确保防爆用呆扳手的安全性，防止在使用过程中引发火灾或爆炸。

2. 提高质量：通过检测可以提高防爆用呆扳手的产品质量，增强其市场竞争力。

3. 延长使用寿命：通过检测可以发现呆扳手的潜在问题，及时进行维修和更换，延长其使用寿命。

4. 降低维护成本：通过定期检测可以及时发现呆扳手的问题，避免因故障导致的停机和维修成本。

5. 提高工作效率：通过检测可以确保呆扳手的正常使用，提高工作效率，减少因工具故障导致的生产损失。

　　以上是关于批量rna测序检测相关的简单介绍，具体试验/检测周期、方法和步骤以与工程师沟通为准。北检研究院将持续跟进新的技术和标准，工程师会根据不同产品类型的特点，选取相应的检测项目和方法，以最大程度满足客户的需求和市场的要求。