病原体ngs检测

检测项目

呼吸道病原体筛查：同步检测甲/乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒等22种病原体，最低检出限200拷贝/mL

血流感染病原鉴定：覆盖革兰阳性/阴性菌、厌氧菌及真菌等150+物种，测序深度≥50×

脑脊液病原宏基因组检测：靶向细菌/病毒/寄生虫等神经系统病原，有效数据量＞10M reads/样本

耐药基因分析：检测β-内酰胺酶类、碳青霉烯酶类等26种耐药机制，灵敏度95%

病毒分型与溯源：实现HPV 16/18型分型、HIV亚型鉴定及突变位点追踪，分辨率0.1%变异频率

肠道病原体检测：涵盖弯曲杆菌、艰难梭菌等病原体，样本处理采用抗抑制剂技术

移植感染风险监测：巨细胞病毒/EB病毒载量定量分析，动态范围10²~10⁷ IU/mL

未知病原体发现：通过de novo组装识别新型病毒，序列覆盖度≥85%

病原载量定量：采用内参基因spike-in技术，定量误差≤±0.5 log

混合感染解析：多重感染样本中病原体组成比例分析，组分分辨率达5%占比

环境样本病原监测：空气/水体样本中军团菌、诺如病毒等检测限50CFU/L

病原进化分析：基于全基因组SNP构建系统发育树，突变位点定位精度99.9%

检测范围

临床标本：全血/血浆、脑脊液、肺泡灌洗液等体液样本

病理组织：福尔马林固定石蜡包埋组织切片

公共卫生样本：污水厂进出水、冷链食品表面拭子

药品生物负载：注射剂/生物制品中微生物污染物

移植供体筛查：造血干细胞捐献者血液病原体排查

危重症感染：脓毒症患者多器官病原体分布检测

生殖道感染：宫颈脱落细胞HPV整合位点分析

兽医诊断：畜禽类口蹄疫病毒、禽流感病毒监测

培养基质控：细胞培养中支原体污染溯源

法医物证：腐败组织微生物种属推断死亡时间

耐药菌监测：ICU环境多重耐药菌定植热点追踪

检测标准

ISO/IEC 17025:2017 检测实验室能力通用要求

GB/T 37874-2019 高通量测序数据质量控制要求

CLSI-MM18 宏基因组学检测临床实践指南

WS/T 805-2022 病原微生物宏基因组测序技术流程

ISO 20395:2019 生物样本核酸定量技术要求

GB/T 38561-2020 病原微生物数据库构建规范

FDA-QSR 21CFR Part11 电子记录管理规范

YY/T 1723-2020 高通量测序仪通用技术要求

EP12-A2 分子诊断方法评价指南

ISO 15189:2012 医学实验室质量和能力要求

检测仪器

Illumina NovaSeq 6000测序系统：双通道流动槽实现20亿reads/run产出，支持PE150测序模式

Nanopore GridION核酸测序仪：实时长读长测序技术，单读长最长＞4Mbp

Qiagen QIAseq FX DNA文库构建系统：自动化完成片段筛选与接头连接，建库通量96样本/批次

Agilent 4200 TapeStation核酸分析仪：通过电泳评估DNA文库片段分布，检测范围35-10000bp

Beckman Coulter Biomek i7自动化工作站：精准移液处理临床样本，交叉污染率＜0.001%

Thermo Fisher KingFisher Flex核酸提取仪：磁珠法纯化病原体核酸，提取效率＞90%

IDT xGen杂交捕获系统：针对低丰度病原体进行靶向富集，特异性＞85%

Bio-Rad QX200微滴式数字PCR仪：验证NGS检测结果，绝对定量精度99%

检测优势

1. 确保安全：通过检测可以确保防爆用呆扳手的安全性，防止在使用过程中引发火灾或爆炸。

2. 提高质量：通过检测可以提高防爆用呆扳手的产品质量，增强其市场竞争力。

3. 延长使用寿命：通过检测可以发现呆扳手的潜在问题，及时进行维修和更换，延长其使用寿命。

4. 降低维护成本：通过定期检测可以及时发现呆扳手的问题，避免因故障导致的停机和维修成本。

5. 提高工作效率：通过检测可以确保呆扳手的正常使用，提高工作效率，减少因工具故障导致的生产损失。

　　以上是关于病原体ngs检测相关的简单介绍，具体试验/检测周期、方法和步骤以与工程师沟通为准。北检研究院将持续跟进新的技术和标准，工程师会根据不同产品类型的特点，选取相应的检测项目和方法，以最大程度满足客户的需求和市场的要求。