总肽含量测定：通过色谱分离与标准品比对，定量分析样品中所有肽类物质的总量，评估产品中活性成分的总体水平。
特定序列肽鉴定：利用保留时间与质谱联用技术，识别样品中是否存在目标氨基酸序列的肽段。
肽纯度分析：检测主峰面积占比，评估目标肽相对于杂质（如缺失肽、降解产物）的纯净程度。
分子量分布测定：采用尺寸排阻色谱或多角度光散射检测器，分析肽混合物的分子量范围与聚合状态。
疏水性表征：通过反相色谱保留行为评估肽的疏水性强弱，为分离纯化工艺提供参数依据。
降解产物监测：识别并定量肽在储存或加工过程中产生的水解片段或氧化修饰产物。
手性氨基酸分析：使用手性色谱柱分离D/L型氨基酸构成的肽，评估光学纯度与合成准确性。
翻译后修饰分析：检测磷酸化、糖基化等修饰肽段的存在与位点，适用于生物制药质量控制。
二硫键定位：通过还原与非还原条件对比色谱图谱，确定肽链内或链间二硫键的连接方式。
杂质谱分析：系统识别并量化工艺相关杂质（如截断肽、插入肽）与产品相关杂质。
合成多肽药物：用于治疗或诊断的化学合成肽类原料药及制剂，需严格控制纯度与序列准确性。
